Kom Ombo, élevé à l'époque ptolémaïque,  présente la particularité d'être un temple double. Il fut en effet dédié à deux divinités : Sobek, le dieu crocodile, et Horus sous sa forme locale. Une double porte ouvre ainsi en façade et cette gémelité se poursuit jusqu'au sanctuaire, formé de deux naos côte à côte.

   Le mur extérieur des naos, porte des scènes empruntées à l'art de la médecine. On peut y voir une série d'instruments chirurgicaux.

   Sur l'esplanade au nord du temple, se trouve un Nilomètre. Bon nombre de temples étaient pourvus de puits profonds, en relation avec la nappe souterraine du Nil. Les parois étaient graduées (l'unité était le bras), ce qui permettait de mesurer chaque année le niveau de la crue, et de prévoir le volume de la récolte. Cet instrument de mesure servait aux gouverneurs pour estimer les revenus publics, ceux-ci étant d'autant plus élevés que la crue était abondante.